Đặc điểm phân đoạn gen HA và NA vi rút của cúm mùa gây bệnh trên các bệnh nhân viêm phổi nặng nghi do vi rút thu thập tại một số bệnh viện miền Bắc Việt Nam, 2013-2015

Đặc điểm phân đoạn gen HA và NA vi rút của cúm mùa gây bệnh trên các bệnh nhân viêm phổi nặng nghi do vi rút thu thập tại một số bệnh viện miền Bắc Việt Nam, 2013-2015
Genetic characterization of HA and NA gene of seasonal influenza viruses caused severe viral pneumonia in patient admitted hospitals, Northern Vietnam 2013-2015
Tác giả: Hoàng Vũ Mai Phương, Lê Thị Thanh, Nguyễn Cơ Thạch, Ứng Thị Hồng Trang, Vương Đức Cường, Phạm Thị Hiền, Nguyễn Phương Anh, Trần Thu Hương, Hoàng Thu Hương, Nguyễn Vũ Sơn, Phạm Thị Thu Hằng, Nguyễn Lê Khánh Hằng
Tóm tắt:
Vi rút cúm là một trong những tác nhân chính gây hội chứng cúm và viêm đường hô hấp cấp tính nặng. Nghiên cứu thực hiện xác định đặc điểm di truyền học của vi rút cúm mùa trên các bệnh nhân viêm phổi nặng nghi do vi rút thu thập tại một số bệnh viện ở miền Bắc Việt Nam, 2013-2015. Xét nghiệm RT-PCR 601 mẫu bệnh phẩm dịch họng và dịch nội khí quản cho kết quả dương tính 31,9%, trong đó 19,1% A/ H3N2, 8,5% A/H1N1pdm09 và 4,3% cúm B. Các mẫu dương tính RT-PCR có tỉ lệ phân lập trên tế bào MDCK đạt 66%. Cây phát sinh chủng loại HAH3 cho thấy các vi rút trong năm 2013 thuộc nhóm 3C.3b, năm 2014 tập trung trong nhóm 3C.3a, nhóm 3C.2a lưu hành nổi trội tại Việt Nam năm 2015. Phân đoạn gen HA1-H3 biến đổi nhanh hơn HA-H1pdm09, các vi rút lưu hành cuối năm 2015 có biểu hiện giảm độ tương đồng với chủng văc-xin mùa cúm 2015-2016 (A/Switzerland/9715293/2013). Cây phát sinh chủng loại phân đoạn gen HA vi rút A/H1N1pdm09 năm 2013 thuộc nhóm 6C, năm 2014 thuộc nhóm 6B. Các protein NA của vi rút cúm A không mang đột biến liên quan đến giảm độ nhạy cảm của vi rút cúm với thuốc kháng vi rút. Vi rút cúm B gây viêm phổi nặng năm 2013-2014 thuộc hai dòng B/Victoria và B/Yamagata, năm 2015 thuộc dòng B/Yamagata, tương đồng với các chủng văc-xin cho các mùa cúm từ 2013-2015.