Dịch tễ sinh học phân tử của vi rút Rubella tại Việt Nam, 2008-2013

Dịch tễ sinh học phân tử của vi rút Rubella tại Việt Nam, 2008-2013
Molecular characteristics of rubella virus in Vietnam, 2008 – 2013
Tác giả: Triệu Thị Thanh Vân, Phạm Thị Thu Hằng, Nguyễn Thị Mai Duyên, Đỗ Phương Loan
Tóm tắt:
Vi rút rubella là một trong những căn nguyên quan trọng gây sốt phát ban ở Việt Nam đặc biệt là khả năng gây hội chứng rubella bẩm sinh ở trẻ sơ sinh khi bà mẹ nhiễm vi rút rubella, nhất là trong 3 tháng đầu của thai kỳ. Trong nghiên cứu này, chúng tôi tiến hành xác định kiểu gen và phân tích đặc điểm sinh học phân tử của vi rút rubella lưu hành tại Việt Nam trong giai đoạn từ 2008 đến 2013. Tổng số trình tự nucleotide của chủng vi rút rubella được phân tích là 63 trình tự bao gồm 16 trình tự nucleotide được thực hiện trong nghiên cứu này và 47 trình tự được thu thập trên ngân hàng gen. Kết quả cho thấy các chủng rubella trong nghiên cứu này đều thuộc kiểu gen 2B nhưng chia thành hai phân nhóm: phân nhóm 1 gồm các chủng lưu hành năm 2008-2010 và phân nhóm 2 gồm các chủng lưu hành sau năm 2010. Sự khác biệt về nucleotide giữa hai phân nhóm là 4.2%. Phân nhóm 2 là phân nhóm lưu hành rộng rãi nhất hiện nay của kiểu gen 2B. Tốc độ tiến hóa của chủng vi rút rubella lưu hành tại Việt Nam là 1.43×10-3 thay đổi/vị trí/năm. Tổ tiên chung gần nhất của kiểu gen 2B lưu hành tại Việt Nam là khoảng năm 1993, của phân nhóm 1 là 2001 và phân nhóm 2 là 2007.