Phát triển qui trình nested PCR chẩn đoán Clostridium difficile gây tiêu chảy sau dùng kháng sinh ở người

Phát triển qui trình nested PCR chẩn đoán Clostridium difficile gây tiêu chảy sau dùng kháng sinh ở người
Development of a nested PCR method for the diagnosis of Clostridium difficile – associated diarrhea in human
Tác giả: Vũ Thị Thu Hường, Nguyễn Duy Hà, Phùng Thị Thu Hằng, Phạm Thị Hồng Thủy, Đặng Thị Thùy Dương, Nguyễn Thị Hương Giang
Tóm tắt:
Chúng tôi đã phát triển thành công qui trình chẩn đoán vi khuẩn Clostridium difficile (C. difficile) sinh độc tố bằng kỹ thuật nested PCR trong phân của bệnh nhân tiêu chảy sau dùng kháng sinh tại Bệnh viện Bạch Mai. Các thông số tối ưu cho qui trình PCR bao gồm: nồng độ mồi là 0,3 μM, nồng độ MgCl2 là 2 mM, nhiệt độ bắt cặp 550C. Giới hạn phát hiện của qui trình nested PCR là 1,2 x 101 copies/μl. Độ nhạy và độ đặc hiệu lý thuyết trên các chủng vi khuẩn là 100%. Trên 115 mẫu bệnh phẩm phân của bệnh nhân tiêu chảy sau dùng kháng sinh tại Bệnh viện Bạch Mai, kết quả dương tính với phương pháp nested PCR và nuôi cấy lần lượt là 26/115 (22,6%) và 20/115 (17,4%). So sánh với phương pháp nuôi cấy, nested PCR có độ nhạy và độ đặc hiệu lâm sàng, giá trị dự đoán dương tính, giá trị dự đoán âm tính lần lượt là 95%, 92,6%, 73,1% và 98,9%. Độ tương đồng của hai phương pháp có tỷ lệ đồng thuận là 93% và hệ số Kappa là 0,8. Qui trình nested PCR có khả năng phát hiện nhanh chóng, đặc hiệu và chính xác vi khuẩn C. difficile sinh độc tố, và có thể được sử dụng như một công cụ chẩn đoán nhanh và nghiên cứu dịch tễ học sự nhiễm của vi khuẩn C. difficile trên bệnh nhân tiêu chảy sau dùng kháng sinh tại các bệnh viện